Hauptdestinatäre sind Institutionen der medizinischen Forschung und Institutionen im Grenzbereich zwischen medizinischer Forschung und sozialer Tätigkeit. Bedeutende Destinatäre der vergangenen Jahre sind:

- CHUV - Centre hospitalier universitaire vaudois, Lausanne
- ETH Zürich - Eidgenössische Technische Hochschule Zürich
- FRAGILE Suisse, Zürich
- Inselspital Bern
- IRB - Institut für biomedizinische Forschung, Bellinzona
- Rock Your Life! Schweiz GmbH, Bern
- Schweizerisches Tropen- und Public-Health-Institut, Basel
- Stiftung I care for you, Bern
- Stiftung MERCATO Aarberg
- Theodor Koch Institut, Bern
- Universitäre Pschiatrische Dienste, Universität Bern
- Universität Basel, Institut für Pflegewissenschaft
- Universitäts-Kinderspital Zürich
- Universitätsklinik Balgrist
- Universitätsspital Basel, Institut für klinische Epidemiologie und Biostatistik
- Universitätsspital Basel, Transplantationsimmunologie & Nephrologie
- UniversitätsSpital Zürich, Klinik für Neonatologie
- Université de Genève
- Wohnwerk Basel

Des Weiteren wurden in Zusammenarbeit mit der Schweizerischen Akademie der Medizinischen Wissenschaften (SAMW) mehrjährige Grossprojekte realisiert. Unter anderem im Bereich:

- Nachwuchs in klinischer Forschung
- Palliativ Care
- Versorgungsforschung

Daneben wird eine grosse Anzahl von kleineren lokalen Projekten mit Beiträgen unterstützt. Die Bangerter-Stiftung gewährt auch immer wieder an Nachwuchs-Forscher Beiträge, Stipendien und Darlehen.

Die Bangerter-Stiftung vergibt je nach Gesuch ihre Unterstützungen in Form von Zuwendungen, Darlehen und/oder Stipendien.

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